Enligt IPMA kommer vädret på Portugals fastland fram till tisdag att påverkas av ett lågtryck som ligger sydväst om Iberiska halvön.
På grund av depressionen väntas damm komma in över kontinenten från Nordafrika, vilket bör ha låg koncentration, men kan tillfälligt öka mellan slutet av lördagen och söndagen.
En ökning av molnigheten förutses också från och med idag, med möjlighet till skurar i Algarve senare under dagen.
På lördag kommer skurarna att vara i söder och kan utvidgas till den centrala regionen från och med eftermiddagen. På söndag kommer skurarna att vara svaga och sällsynta, och öka i frekvens igen på måndag och tisdag, och kan under dessa dagar även förekomma i norr.
"Denna vädersituation är förknippad med en viss osäkerhet främst på grund av denna depressions position. Det bör noteras att regnregimen förutsätter intermittent och spridd nederbörd, både rumsligt och tidsmässigt", säger IPMA i ett uttalande.
När det gäller temperaturen anger IPMA att den kommer att genomgå små variationer, med minimivärden mellan 08 och 13 grader Celsius vid kusten och mellan 06 och 09 grader i inlandet, och vara något lägre, mellan 03 och 6 grader Celsius i det inre norr och Beira Alta.
Maximitemperaturen kommer att vara högre än normalt för den här tiden på året, mellan 17 och 24 grader på större delen av fastlandet.
Vinden kommer att vara svag till måttlig och blåsa måttlig till stark i Algarve på lördag och på höglandet, särskilt i centrum och söder.
IPMA förutspår också havsstörningar, med vågor på Algarves sydkust på 1 till 2 meter och mellan 2 och 2,5 meter i dag och på lördag.
För ögruppen Madeira väntas perioder med moln och förekomst av skurar, särskilt på de norra sluttningarna och högländerna.
På måndag och tisdag minskar sannolikheten för att nederbörd ska förekomma och skurar, om de inträffar, kommer generellt sett att vara svaga.
Man räknar också med måttlig till stark vind och maximala temperaturer mellan 16 och 22.
På Azorerna kan man mellan idag och måndag förvänta sig molnighet men växlande på alla öar och betydande nederbörd väntas inte.
På tisdag kommer "närmandet och passagen av en kallfrontsytan med svallvågor, med långsam rörelse och måttlig aktivitet" att påverka vädret på alla öar, med början på öarna i den västra gruppen och med en gradvis utbredning över resten av skärgården.
Därför väntas en ökad molnighet med perioder av lätt regn som övergår i lätta skurar och, endast på öarna Fores och Corvo, en liten ökning av vindstyrkan.
Temperaturerna kommer att variera mellan 15 och 17 grader.