Carlos Cortes talade med journalister i slutet av ett besök på Bragasjukhuset och medgav att den politiska krisen till följd av premiärministerns avgång och det efterföljande avbrottet i förhandlingarna mellan regeringen och läkarfacken har lagt till "en faktor av större instabilitet" för hur den nationella hälsovårdstjänsten(SNS) fungerar.
"Det bästa scenariot är att regeringen snarast löser de problem vi har på bordet. Såvitt jag vet har vi fortfarande en hälsominister, vi har fortfarande en regering, så detta fortsätter att vara i regeringens händer och, för närvarande, även republikens president", sade han.
För presidenten är det "mitt i allt detta nödvändigt att förstå vad som fortfarande är möjligt att etablera, fortfarande möjligt att lösa i SNS", även med den nuvarande ministern.
"Hälsa kan inte vänta, hälsa kan inte vänta på val, hälsa kan inte vänta på utnämningen av en annan premiärminister, hälsa kan inte vänta på hälsoministerns mindre eller större kapacitet för utförande och ingripande", tillade han.
Carlos Cortes sade att, enligt hans personliga åsikt, klargörandet av landets "oklara situation" "endast kan ske genom val.
Under tiden kommer ordern att invänta republikens presidents beslut om landets politiska framtid, innan man uttalar sig om stegen i läkarnas kamp.
Premiärminister António Costa bad republikens president om hans avgång på tisdagen efter att det offentliga ministeriet avslöjat att han är målet för en oberoende utredning av Högsta domstolen om litium- och vätgasprojekt.