Miguel Oliveira, uit Almada, kwam zwaar ten val in bocht vier van het Indonesische Mandalika circuit en werd ongeschikt verklaard door de kampioenschapsartsen.
Oliveira werd naar een plaatselijk ziekenhuis gebracht om verdere tests te ondergaan om te bepalen of hij een operatie moet ondergaan om de breuk te corrigeren.
"Hij zal een driedimensionale CT-scan ondergaan in het ziekenhuis van Mataram om te beoordelen of een operatie nodig is," kondigde het Noord-Amerikaanse team Trackhouse aan.
Dit is de eerste race die de Portugese coureur dit seizoen mist door een blessure.
Oliveira, 29, bezet momenteel de 14e plaats in het MotoGP wereldkampioenschap met 71 punten.
De Spanjaard Jorge Martin (Ducati) leidt met 24 punten voorsprong op de Italiaan Francesco Bagnaia (Ducati).