Tillkännagivandet gjordes av den amerikanska myndigheten för atmosfär och hav (NOAA).
Det globala genomsnittet på 16,55 ºC i juni var 1,05 ºC över 1900-talets genomsnitt. Enligt NOAA var detta första gången som ett månadsmedelvärde låg mer än en grad över den normala temperaturen.
Andra klimatövervakningssystem, som NASA, Berkeley Earth och det europeiska Copernicus, hade redan påpekat att juni förra året hade varit den varmaste sedan det fanns ett rekord, men NOAA anses vara standarden för rekord, med data som går tillbaka till 1850.
Ökningen under den sista månaden i juni är "ett stort steg", eftersom de globala månadsregistren normalt har en så bred informationsbas att de kan upptäcka variationer på hundradels grader, och inte bara på tiondelar, betonade Ahira Sanchez-Lugo, klimatforskare från NOAA.
"De senaste temperaturerna, liksom de extrema bränder, föroreningar och översvämningar vi ser i år, är vad vi förväntar oss att se i ett varmt klimat", säger Natalie Mahowald, klimatforskare vid Cornell University. "Vi håller bara på att få en liten försmak av den typ av effekter som förväntas av klimatförändringarna", fortsatte hon.