Les réservations pour la compagnie aérienne sont déjà ouvertes et se concentrent sur les vols de correspondance pour Lufthansa à partir de ses principaux hubs de Francfort et de Munich.
Parallèlement à la filiale existante Lufthansa CityLine, la nouvelle Lufthansa City desservira à terme des liaisons intérieures et européennes à partir de ses bases de Munich et de Francfort.
En 2024, les destinations intérieures comprendront Berlin, Brême, Cologne, Bonn, Düsseldorf, Hambourg et Hanovre.
En dehors de l'Allemagne, la compagnie aérienne desservira Bordeaux en France, ainsi que Manchester et Birmingham au Royaume-Uni.