Enligt Institute of the Sea and Atmosphere(IPMA) gäller varningen för distrikten Viana do Castelo, Braga, Porto, Aveiro, Coimbra och Leiria från 5:30 till 12:00 idag.
Nordvästliga vågor på 7 till 8 meter förväntas och når en maximal höjd på 15 meter, indikerar IPMA.
De återstående distrikten på den portugisiska kusten (Lissabon, Setúbal, Beja och Faro) är under orange varning fram till 21:00 idag, med vågor som förväntas från väst eller nordväst med en betydande höjd på 5 till 6,5 meter, som kan nå 14 meter i höjd.
På grund av oroligheter till havs är 13 havsbarer idag stängda för all navigering och fem är begränsade, enligt information som finns tillgänglig på den portugisiska marinens webbplats.
Enligt marinen är barerna i Caminha, Douro, Esposende, Figueira da Foz, Vila Praia de Âncora, Póvoa de Varzim, Vila do Conde, Ericeira, S. Martinho do Porto, Alvor, Vila Real de Santo António, Quarteira och Tavira.
Barerna i Aveiro, Leixões, Viana do Castelo, Faro och Olhão har restriktioner.
De återstående 29 stängerna är öppna för all navigering.
IPMA utfärdade också en orange varning för Madeiras nordkust och Porto Santo på grund av oroligheter till havs mellan 21.00 på lördag och 12.00 på söndag, som senare ändrades till gul.
Madeira har också en gul varning på grund av prognosen för perioder med regn eller skurar, ibland kraftiga och åtföljda av åskväder (mellan 12:00 och 21:00 på lördag) och starka sydvästvindar med byvindar på upp till 70 km/h, på väg mot nordväst med byvindar på upp till 90 km/h.
Vindvarningen kommer att gälla mellan kl. 15.00 på lördagen och kl. 06.00 på söndagen.