Lissabon heeft nu twee maanden de tijd om adequaat te reageren op de kwesties die in de kennisgevingsbrief aan de orde worden gesteld en als dit niet gebeurt, kan de Commissie besluiten een met redenen omkleed advies te sturen.

Volgens Brussel heeft Portugal geen systeem opgezet voor toezicht op de toevallige vangst en dood van beschermde soorten zoals de gewone dolfijn (Delphinus delphis), de tuimelaar (Tursiops truncatus) en de rivierdolfijn (Phocoena phocoena) in de wateren onder zijn jurisdictie, soorten die strikt beschermd zijn krachtens de Habitatrichtlijn.

Het uitvoerend orgaan van de Gemeenschap is ook van mening dat Portugal niet de nodige stappen heeft ondernomen om een significante verstoring van de laatste twee soorten in verschillende Natura 2000-gebieden die voor hun bescherming zijn aangewezen, te voorkomen.