"Sedan den 6 december har andelen sannolika fall av Omicron-varianten ökat kraftigt och nådde den 10 januari en uppskattad andel på 93,2 %", står det i rapporten från det nationella hälsoinstitutet Doutor Ricardo Jorge (INSA) om den genetiska mångfalden av SARS-CoV-2.

Den 3 januari hade Omicron redan nått en frekvens på 89,6 % av de fall av smittade som registrerats i landet.

Enligt institutet som övervakar utvecklingen av detta coronavirus i Portugal motsvarar Omicrons "plötsliga ökning av cirkulationen i samhället" det scenario som observerats i länder som Storbritannien och Danmark.

Enligt INSA upptäcktes denna variant för första gången i Portugal under veckan 22-28 november, efter att ha registrerat en "galopperande ökning av cirkulationen under december månad".

"Sekvenseringsuppgifterna visar fortfarande på betydande heterogenitet i regionala termer", vilket tyder på att antalet introduktioner och tidpunkten , liksom början på en bredare spridning i samhället, inträffade på olika sätt i de olika regionerna i landet.

"I själva verket skedde spridningen i samhället av Omicron-varianten tidigare och mer intensivt i Lissabon- och Tagusdalen, och den blev dominerande ungefär en till två veckor tidigare än i de andra regionerna", heter det i rapporten.

När det gäller Delta, den variant som var dominerande i Portugal under flera månader, "har dess relativa frekvens minskat sedan veckan den 22-28 november som ett resultat av den plötsliga ökningen av Omicron-variantens cirkulation".

"Bland de olika underlinjerna av Deltavarianten som fortfarande är i omlopp utmärker sig AY.4.2, som under veckan den 27 december 2021 till den 2 januari 2022 fortfarande hade en betydande cirkulation i Algarve", säger INSA.

Som en del av den pågående övervakningen av den genetiska mångfalden av SARS-CoV-2 har i genomsnitt 527 sekvenser per vecka analyserats sedan början av juni 2021.

Dessa sekvenser har erhållits från prover som samlats in slumpmässigt i laboratorier spridda över de 18 distrikten på Portugals fastland och de autonoma regionerna Azorerna och Madeira, vilket täcker i genomsnitt 132 kommuner per vecka.