I ett uttalande sade DGS att det skedde en ökning av överföringen av Covid-19, med 16 fall på sju dagar per 100 000 invånare den 9 juni, vilket visar en ökande trend.
Detta värde översteg förra vinterns "topp" incidens på 12 fall var sjunde dag per 100 000 invånare, men är lägre än det som registrerades förra sommaren på 42 fall per 100 000 invånare, säger DGS.
Uppgifter som konsulterats av Lusa på DGS-portalen visar att mellan den 9 och 16 juni bekräftades 2 337 fall av Covid-19 och 68 dödsfall registrerades i Portugal.
Enligt uttalandet sammanfaller denna tillväxt med den ökade förekomsten av en ättling till JN.1-sublinjen av coronaviruset, KP.3, som nyligen klassificerades som en variant under övervakning av Europeiska centrumet för förebyggande och kontroll av sjukdomar (ECDC).
"Det finns också en ökande trend i andelen akutfall på grund av covid-19 i alla regioner och åldersgrupper, där ökningen är mer påtaglig i äldre åldersgrupper", tillade generaldirektoratet.
Enligt DGS-data motsvarade den specifika dödligheten till följd av covid-19 nio dödsfall var 14:e dag per miljon invånare, ett värde som är lägre än de högsta värden som registrerades under den senaste vintern och sommaren, 10 respektive 13 dödsfall per miljon invånare.
Alla värden ligger under ECDC:s tröskelvärde på 20 dödsfall var 14:e dag per miljon invånare, säger DGS.
DGS rekommenderar att man vid symtom som hosta, feber, huvudvärk och andningssvårigheter ska bära mask, hålla fysiskt avstånd och undvika slutna miljöer eller folksamlingar.