Cláudio Coimbra, de 22 años, y Vadym Hrynko, de 21, permanecerán detenidos en la cárcel de Tomar.
El juez Carlos Alexandre justificó la prisión preventiva por razones de peligro de alteración de la investigación y del orden público, así como por el peligro de continuación de la actividad delictiva.
Los dos marinos están acusados del delito de homicidio calificado y de tres delitos de ofensas calificadas a la integridad física.
Según una fuente de la Policía Judicial (PJ), los dos marinos fueron detenidos el lunes por la noche - junto con un tercer sospechoso, un civil, que ya ha sido liberado por el Ministerio Público (MP).
El agente Fábio Guerra, de 26 años, falleció el lunes por la mañana en el Hospital de São José, en Lisboa, debido a las "graves lesiones cerebrales" sufridas como consecuencia del ataque del que fue objeto a la salida de la discoteca Mome.