Cláudio Coimbra, 22, und Vadym Hrynko, 21, werden weiterhin im Gefängnis von Tomar festgehalten.
Richter Carlos Alexandre begründete die Sicherungsverwahrung mit der Gefahr der Störung der Ermittlungen und der öffentlichen Ordnung sowie mit der Gefahr der Fortsetzung krimineller Aktivitäten.
Die beiden Marinesoldaten werden des Verbrechens des qualifizierten Mordes und dreier Verbrechen der qualifizierten Verletzung der körperlichen Unversehrtheit beschuldigt.
Nach Angaben der Justizpolizei (PJ) wurden die beiden Marinesoldaten am Montagabend festgenommen - zusammen mit einem dritten Verdächtigen, einem Zivilisten, der inzwischen vom Ministerium für öffentliche Angelegenheiten (MP) freigelassen wurde.
Der Agent Fábio Guerra, 26, starb am Montagmorgen im Hospital de São José in Lissabon an "schweren Hirnverletzungen", die er sich bei dem Angriff vor dem Nachtclub Mome zugezogen hatte.