Flygbolaget varnade för att den obegränsade åtgärden kommer att ha en "kumulativ och negativ inverkan" på kunderna, vilket kan leda till inställda flyg i sista minuten.
I ett uttalande sa Aer Lingus: "För att skydda så många tjänster som möjligt från effekterna av stridsåtgärderna måste vi ställa in mellan 10 och 20 procent av våra flygningar under de första fem dagarna - onsdag 26 till söndag 30 juni.
"Dessa inställda avgångar kommer att genomföras under de kommande två dagarna. Detta steg är nödvändigt för att skydda så många tjänster som möjligt för våra kunder."
Aer Lingus meddelade också att det finns flera alternativ för kunder som påverkas av stridsåtgärderna från Irish Air Line Pilots' Association.
Kunderna kan ändra sina flygningar gratis, ställa in sina flygningar och kräva återbetalning eller en voucher.
Aer Lingus betonade att stridsåtgärderna sammanfaller med semesterperioden för familjer.
Flygbolaget uppgav: "Vi kommer att göra allt vi kan för att minimera påverkan på kunderna. Störningar är dock oundvikliga på grund av denna industriella åtgärd. Vi kommer att kommunicera eventuella ändringar, förseningar eller inställda avgångar till berörda kunder så snart som möjligt.
"Vid inställda avgångar kommer vi att försöka omboka kunder snabbt och kommer att samarbeta med partnerflygbolag och hyra in ytterligare flygplan om det behövs."