La aerolínea advirtió de que la huelga indefinida tendrá un "impacto acumulativo y negativo" en los clientes, pudiendo provocar cancelaciones de vuelos de última hora.
En un comunicado, Aer Lingus dijo: "Para proteger el mayor número posible de servicios del impacto de la huelga, debemos cancelar entre el 10% y el 20% de nuestros vuelos durante los cinco primeros días, del miércoles 26 al domingo 30 de junio.
"Estas cancelaciones se llevarán a cabo en los próximos dos días. Esta medida es necesaria para salvaguardar el mayor número posible de servicios para nuestros clientes."
Además, Aer Lingus anunció varias opciones para los clientes afectados por la huelga de la Asociación Irlandesa de Pilotos de Líneas Aéreas.
Los clientes pueden cambiar sus vuelos gratuitamente, cancelarlos y solicitar un reembolso o un vale.
Aer Lingus destacó que la huelga coincide con la temporada alta de vacaciones para las familias.
La aerolínea declaró: "Haremos todo lo posible para minimizar el impacto en los clientes. Sin embargo, las interrupciones son inevitables debido a esta huelga. Comunicaremos cualquier cambio, retraso o cancelación a los clientes afectados lo antes posible".
"En caso de cancelaciones, intentaremos reacomodar a los clientes rápidamente y trabajaremos con aerolíneas asociadas y contrataremos aviones adicionales si es necesario".