Tras la muerte de sus padres, lo donó todo a los pobres y comenzó sus estudios teológicos. A su debido tiempo, fue ordenado sacerdote por monseñor Lampert, obispo de Cracovia, a quien sucedió en 1072. Visitaba sus parroquias todos los años, provocando una renovación espiritual entre el clero y los laicos. Su casa estaba siempre abarrotada de pobres, y llevaba una lista de viudas y miserables a los que distribuía limosnas sistemáticamente.
Polonia estaba entonces gobernada por el rey Boleslao II, que había secuestrado a una mujer casada para satisfacer sus deseos lujuriosos. Después de que San Estanislao le reprendiera por su adulterio, el rey se enfureció y cortó la entrevista con amenazas. Ante tal obstinación, el obispo no tuvo más remedio que dictar una sentencia de excomunión.
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Cuando el rey entró en la catedral de Cracovia, comprobó que los oficios se habían suspendido de inmediato por orden del obispo. Furioso, persiguió al santo hasta la pequeña capilla de San Miguel, a las afueras de la ciudad, y lo mató mientras celebraba la misa. Los guardias cortaron el cuerpo en pedazos y los esparcieron para que fueran devorados por las fieras. San Estanislao murió en 1097 y sus reliquias se depositaron en la catedral de Cracovia.