Toen hij een jonge jongen was verdween hij uit zijn huis. Er is niets bekend over hoe dit gebeurde. Zijn moeder stierf kort na zijn verdwijning en zijn vader ging bij de Franciscanen. Hij kwam terecht in Toledo, Spanje en werd opgenomen door Francisco Mayoral die hem aan het werk zette als herder. Toen hij 20 was ontdekte hij dat Mayoral wilde dat hij met zijn dochter trouwde, dus ging hij bij het Spaanse leger.


Op een gegeven moment kwam hij in de buurt van Portugal waar hij een oom opspoorde die hem over zijn ouders vertelde. Toen hij zich realiseerde dat hij geen banden had met Portugal ging hij terug naar Spanje.


Hij zwierf door verschillende landen en zou een visioen hebben gehad van het Kind Jezus die hem naar Granada stuurde . Daar vond hij werk aan een nieuwe drukpers.

Hij beleefde een religieuze bekering op het feest van Sint Sebastiaan. Hij begon zichzelf publiekelijk te vernederen door zich te slaan en om genade te smeken voor zijn vroegere leven. Hij werd naar een psychiatrische inrichting gestuurd en kreeg daar bezoek van Johannes van Avila die hem vertelde dat hij voor anderen moest zorgen.


Hij bracht mensen bijeen die zich bekommerden om de armen en de zieken, die vandaag de dag bekend staan als de Broeders Hospitaalridders van Sint Jan van God.

Hij stierf aan longontsteking op zijn verjaardag nadat hij in een rivier sprong om een jonge man te redden. Zijn feestdag wordt gevierd op 8 maart en hij wordt erkend als een van de leidende religieuze figuren op het Iberisch schiereiland. Hij is de patroonheilige van boekverkopers, ziekenhuizen, verpleegsters, geesteszieken en stervenden.