Le classement du bien, qui comprend la grue extérieure, se réfère au texte publié dans DR, "reflète les critères" exigés par la loi pour cette distinction, à savoir "le génie du créateur respectif, l'intérêt du bien en tant que témoignage remarquable d'expériences ou de faits historiques, sa valeur esthétique, technique et matérielle intrinsèque, sa conception architecturale, urbaine et paysagère et son extension ainsi que ce qui s'y reflète du point de vue de la mémoire collective".

Situé sur le front de mer de Miragaia, pour le classement comme monument national, le bâtiment Alfândega se distingue "non seulement par ses dimensions, mais surtout par sa qualité architecturale et son intégration urbaine au cœur de la zone historique de Porto, et dans les limites de la zone de protection spéciale du Centre Historique de Porto, résultant de la zone tampon établie par l'UNESCO".

Le décret, vu et approuvé par le Conseil des ministres le 22 juin, souligne également les "profonds changements urbains et paysagers" que le bâtiment a représentés au 19ème siècle avec "la construction de l'immense quai sur la plage de Miragaia, sa connexion, par un embranchement ferroviaire, à la gare de Campanhã et l'ouverture de la Rua Nova da Alfândega".

La typologie du bâtiment est "néoclassique d'inspiration anglo-palladienne, implanté longitudinalement par rapport au fleuve, qui s'ouvre, d'une part, sur la ville et, d'autre part, sur le Douro, précédé ici par la grande grue extérieure destinée au chargement et au déchargement du quai fluvial", peut-on lire.

L'utilisation du fer en conjonction avec d'autres matériaux, tels que la pierre, la brique ou le bois, en fonction de la fonctionnalité des différents espaces, articulés par des cours intérieures, est également mentionnée.

Alfândega Nova do Porto abrite le centre de congrès Alfândega et le musée des transports et des communications, après avoir fait l'objet d'une restauration par l'architecte Eduardo Souto de Moura.